Раз рейс могут перенести, а у меня пребывание в Японии займёт 15 дней ( включая день прилёта и улёта)

15-дневную визу дают, 14-дневных не бывает, или это какие-то редкие исключения. В целом в экстренной ситуации можно как-то уладить этот вопрос и получить разрешение на продление пребывания, но я не знаю, как это делается

Если у вас на 15 дней расписана поездка, то визу вам на 15 дней дадут. Находиться при это по ней можно 16 дней (день прилета не считается). Просить больше вам конечно никто не запрещает, но смысл околонулевой. Хотите получить визу на 30 - заявляйте поездку от 17 дней.

Наоборот. Виза на 15 дней технически является визой на 16.

Так как день прилёта не в счёт, потому по ней можно фактически пробыть 16 дней.