Подскажите, на РВП Казахстана для воссоединения с трудовым мигрантом подается в ЦОН по месту жительства или по району работодателя трудового мигранта?

Туда же где и самого мигранта подавали.

Только строго говоря "воссоединение" - это про членов семьи резидентов РК.

Для семей мигрантов там отдельно есть просто "члены семьи трудового мигранта"

по месту регистрации работодателя)

и у вас будет "сопровождение членов семьи трудового мигранта"