Подаю документы на визу Испании. Если изначально указывал паспорт в анкете на сайте один , можно ли при подаче документов ( в анкете ) предоставить второй загранпаспорт ?

Это будет считаться как ошибка.

И в лучшем случае Вас попросят заплатить 15 000 рублей или вообще документы не будут принимать.

Но Вы можете написать или позвонить в ВЦ и спросить.