Подскажите, пожалуйста, хотим уехать на 3 дня из Токио в другой город и не снимать в это время номер в отеле, есть ли возможность у отелей поместить багаж в камеру хранения?

смотрите про yamato transport \ kuroneko

Мы всегда так делаем. Еще ни разу не отказали

Если у вашего отеля есть ресепшен, живой персонал и комната хранения багажа, и вы по возвращении в него же вернетесь- почему нет? Пишите им на почту, спрашивайте, договаривайтесь .