Подскажите, пожалуйста, нормально ли если некоторые окошки в анкете на визу Японии заполнены от руки, а другие на компьютере?

Уточните, какие "некоторые"? Если крестики в квадратиках, то ок. Если наполовину переписана, то лучше на пк полностью заполнить и не усложнять жизнь консульству.