Если оплатил госпошлину в конце февраля, а записаться удалось только в апреле, сама поездка в планах в конце мая, не возникнет ли никаких вопросов по срокам у вц?

Загрузите сразу окончательные варианты. Чем загружать, потом исправлять. Сайт лагает и так.

Вопросов не возникнет. Это нормально. Насколько знаю, сайт не дает удалять старые документы, так что советую подгружать заранее корректные актуальные документы.

Да, можно