Скажите, пожалуйста, хотелось в начале сентября на пару дней побыть на море, но от слова совсем не понимаю в какую сторону смотреть и вообще эта тема хороша развита или нет в Японии ?

Обычно сентябрь - это уже тайфуны. Разве что на Окинаву 🤔

Или вам не принципиально чтобы купаться?

Ну в начале сентября ещё купаются везде, ну может кроме Хоккайдо

если вам море и пляж, то это не Япония. по сходным бюджетом Таиланд, Вьетнам, Мальдивы, Сейшелы.

Миякодзима остров, советую сильно, это та же префектура Окинава, маленький остров, но там много разных пляжей, и снорклинг, и Мальдивские пляжи

Но конечно 2 дня будет мало