Подскажите, пожалуйста, а в японии работают карты юнион пэй ?

работают, но не везде проходят. если вопрос про карту из РФ, то работает единственная от АТБ, никакие другие нет.

Смотря каких банков. Китайские все. РФ - только АТБ.