Посоветуйте, пожалуйста, отели в Токио, удобные в плане транспорта?

Это зависит от мест которые планируете посетить, вообще любой отель около метро. Я всегда селюсь в Kayabachi рядом две линии метро и жд вокзал с синкансенами 20 мин пешком по прямой, и линия Асакуса 15 мин по прямой до аэропорта за 650 йен. Отели Keio Presso, Smile, Sosetsu Kayabachi, ну или по вашему бюджету