Подскажите пожалуйста кто в курсе, имеет ли право приезжать миграционная полиция по месту проживания и проверять ВНЖ в Казахстане по месту регистрации и просить предоставить сфотографироваться с внж?

Проверять проживание по месту регистрации однозначно имеет право. Про фото уточняйте у них, пусть норму закона назовут. Хотя если вы не живете по месту регистрации и миграционная обнаружила это, то остальное не имеет значения уже