Подскажите, пожалуйста, какие вообще могут быть последствия, если я планирую прилететь во Францию с французской визой, а улететь из Германии? Это может повлиять на получение последующих виз?

Нет. В Германии могут задать вопросы: попросить предоставить подтверждение, что большее количество дней вы провели во Франции.

главное в первый въезд по визе въехать в страну визы и чтобы эта страна большую часть времени в итоге заняла в поездке, остальное не важно