Подскажите, если электронную визу оформил не за три дня, а за сутки, могут не пустить в Куала-Лумпур?

Её надо оформлять в течение 3 дней, а не за 3 дня

Всё пустят

Так три дня это максимальный срок, а не минимальный. Если она у вас оформлена на момент вьезда-то всё, "пропуск" есть