Есть ли случаи штрафов на сухопутных границах из-за отсутствия регистрации в Черногории ?

Штраф можно оплатить только в банке/на почте. На месте оплатить не сможете. Регистрация - ваша ответственность. Если вы жили в отеле или бронировали жилье через букинг, покажите скрин и скажите, что уверены, что власник зарегистрировал вас. Вдруг это поможет.

Если есть хоть любое доказательство проживания за оплату (даже устно названный адрес и хорошо если имя хозяина)то Вы не отвечаете никак по Закону.

Штраф за нерегистрацию платит только проживающий в личном жилье и те кто проживают у этого человека так же бесплатно

Шансы на проверку на этой границе минимальны, расслабьтесь!