Подскажите, кто знает: в чём разница между suica и pasmo? И какой картой можно пользоваться по всей Японии?

Разницы нет.

Пользоваться можно во многих регионах Но, например, в тояме и вокруг не действуют особо На окинаве тоже

В оплате проезда и покупок разницы нет. Только возврат залога suica в офисах госкомпании JR, а pasmo в токийском метро (союз частных компаний).