Подскажите по ИП в годовом отчете учитывается сумма фактически поступивших денег на счет или сумма выставленных инвойсов?

Фактически поступивших денег, если это не внесение собственных средств.

Но если вы выставили инвойс в этом году, а вам его оплатят в будущем, вам надо это выставить как zalohovu faktúru. А уже после оплаты выставить "острую" фактуру.