Подскажите пожалуйста, если документы на национальную визу в Германию (воссоединение подали) когда документы проверят, вызовут проставлять в паспорта, можно по доверенности отправить третье лицо забрать? Или курьером в другой город?

Непонятно, что вы понимаете под "вызовут проставлять в паспорта". Вы не сдавали паспорт? Но, можете посмотреть на сайте Visametric в разделе Правила подачи/ получения документов. --- Правила подачи/получения для Национальной визы

Курьером точно можно, но вам лучше об этом заранее уведомить визаметрик, так как это платная процедура. Получателем тоже можно указать третье лицо. Насчет можно ли забрать по доверенности, не подскажу, вроде нет, но это тоже лучше уточить в самом визаметрик, вдруг у них что-то поменялось