Если бронировать отель на букинге в Японию, через другого человека ( у нас нет иностранной карты) , могут ли быть проблемы с заселением если ФИО проживающих и оплачивающего отличаются?

Не должно быть

Гостей только пусть вас укажет

Вообще без разницы, кто платит, главное, как тут уже уточнили, при бронировании указать имена всех гостей

Если он будет бронировать из своего аккаунта, то все нормально. Если эта карта есть у него в аккаунте, и вы оплатите ей в своем аккаунте, то данное бронирование может быть отменено службой безопасности букинга (такое описывалось здесь, примерно год назад)

Если другой человек в своём аккаунте забронирует и оплатит, то нет. Главное на всякий случай уточнить у отеля, нужна ли им при заселении карточка с которой платили (один раз спросили).

А вот если карточкой другого человека платить, то можно попасть на бан от букинга ( были случаи)