Если малайзийскими внутренними авиалиниях можно взять фаст трек по нему я смогу быстрее пройти миграцию и не стоять в очереди?

По логике - да, но я не пользовался, наверняка не скажу.

100% у них на сайте должно быть всё описано.

Просто попроситься без очереди - нормальный вариант. Со всеми бывает. Можно к персоналу обратиться, чтобы они помогли, провели вас к нужному пограничнику.