Подскажите, пожалуйста — если лечу одной компанией, но рейс из Пекина в Осаку через сутки после рейса из Москвы в Пекин, можно ли багаж также отправить дальше на следующий рейс или нужно его забрать?

Обычно при покупке билета будет написано нужна ли повторная регистрация в таком случае.

Если нет, то багаж зарегистрируют до конечной точки. Если да, то вам нужно будет получить багаж и повторно пройти регистрацию для получения следующих билетов.