Поедем через Белоруссию и Литву на машине, из России домой, в Калининград. Могу ли провезти домашние заготовки? Перец острый маринад, аджику? Специи?

Вы не искали. В Литву запрещён ввоз продуктов питания из Беларуси.

Все продукты питания запрещены к ввозу в Литву с территории РФ и РБ.

А когда Вы говорите о правилах транзита,то Вы путаете с коммерческим транзитом (cmr, ,накладные,сертификаты происхождения, гарантии перевозщика на сохранение упаковки на время транзита,кстати, если нет таких гарантий можете воспользоваться услугой таможенного сопровождения от таможенной службы литвы,ну и это все только в отношении неподсанкционных товаров)

По закону вроде запрещено. Если не разрешат, то выкините на границе. Просто скажут выкинуть , никакого наказания. Там есть мусорки. Но часто на закатки закрывают глаза.