У меня автобус из Таллина до Питера в 00:40. Кто-то говорит, что граница закрывается в 23:00. Как есть на самом деле?

Так и есть. Приедете в Нарву часа в 3 и будете ждать открытия границы до 7:00. Занимаете очередь и до 6-6:30 можно в автобусе ждать/спать, договорившись с попутчиками/соседями по очереди.