На биометрию на внж Чехии записаться можно только по телефону? Что спрашивать будут?

Да, когда Вы получаете одобрение выдачи или продления ВНЖ - по телефону записываетесь на биометрию.

Если вопрос "что будут спрашивать" относится к моменту звонка для записи - могут уточнить - получили ли Вы уже подтверждение выдачи/продления, ну и некоторые персональные данные чтобы внести Ваши данные в систему записи...