На будет ли проблем при пересадке в Стамбуле на рейс в Мюнхен с визой Италии ( годовая Уже пересекали граница в этом году) ?

Если предыдущие въезды/выезды по бОльшей части были через Италию, то проблем быть не должно

С открытой ранее мультивизой визой не должно быть проблем, но могут попросить обратный билет из Мюнхена, а по прилете в Германию спросить страховку европейской компании , так же обратные билеты, и где будете жить.