Банк в части выписки предлагает из личного кабинета сделать ее распечатку (то есть это будет черно-белая распечатка с черно-белой печатью) и на ней поставить мокрую печать. Может кто сталкивался, такая выписка подойдет при подаче на визу в Японию?

Там в списке документов написано с мокрой печатью. Просто в любом отделении банка делают за 5 минут выписку, там и накопительные счета и обычный

Если ваш банк предлагает только этот вариант (ВТБ, Альфа), то да, эти выписки принимают. Нужна ещё подпись сотрудника. Один из этих банков ее ставит, второй нет 🤷‍♂