Если ехать с Челябинска до Астаны на поезде с пересадкой в Петропавловске. То как это все происходить будет. В плане, к чему готовиться. Могут ли быть какие-то приколы на границе и тому подобное.

Ничего прям страшного там не будет. Вы на поезде до Петропавловска пройдёте 2 пограничных проверки (сначала российская потом казахстанская). Выйдете в Петропавловске, если прям много часов ждать другой поезд и сумок много, то там на первом этаже есть большая камера хранения, на любые габариты. А на следующий поезд просто садитесь и едете до нового вокзала в Астане. Всё.

Главное иметь все документы в порядке с годными сроками и отсутствие запретов на выезд.