Подскажите, пожалуйста, везу в Эстонию из Питера кошку с Ветеринарным паспортом ЕС. Сертификат на титры к бешенству получили.

Документы на вокзале даёт не таможня, а ветконтроль. Если он там есть. Если его нет, то нужно туда, где он есть.

В одной питерской сббж мне озвучили случай, что именно при въезде в Эстонию не пустили с российскими отметками в паспорте ЕС, а заставили оформлять справку, но вот какую я не припомню, по моему просто справку о здоровье.

Я то же ставила в паспорт ЕС отметки и врач меня предупредила.

Только от бешенства нельзя в других странах ревакцинироваться и отметки , кроме ЕС ставить. В противном случае паспорт ЕС будет действовать как международный с оформлением всех документов.