Подскажите пожалуйста,а если прописан не в Москве,но учишься в вузе здесь ,можно податься на испанскую визу в московском центре?

Если ваша прописка относится к московскому консульскому округу, то да.

Получается что в Питере могут податься только те кто прописан в Питере , а остальные хоть в каком городе получается , если жена моего брата подалась в Новосибе с питерской пропиской без вопросов приняли документы .

Да