Подскажите, где лучше остановиться в Осаке или Киоте?

Смотря какие у Вас цели. Я останавливалась в Киото для осмотра тамошних достопримечательностей и потом в Осаку переехала еще - парк Юниверсал, в Нару оттуда же моталась и т.д.