Сын и я получили боровак Сербии по недвижке в одном городе, но сейчас сын планирует учится в другом городе и жить там в общежитии. Придется ли ему из-за этого менять причину боровака?

Уточните в МУПе как они на это смотрят. Закон требует проживания, но это чтобы не было злоупотреблений. А если квартира не пустует и не сдаётся, просто жилец подолгу отсутствует по уважительной причине (и поэтому зарегистрирован в общежитии). Я бы не считал это нарушением.