Подскажите, как попасть из Самары в Берлин?

В зависимости от ваших оснований въезда в Германию.

Основания «так себе» (туристический шенген) - только через Турцию/сербию/Казахстан

Основания «посолиднее» (внж, виза Д) - можно даже через Калининград и Эстонию автобусами/маршрутками/самолетами