Немного необычный вопрос, вдруг у кого-то есть знакомые случаи - могут ли японцы сейчас поехать в Россию по туристической визе? Посольство не смогло дать конкретный ответ, разве что "не рекомендуется", но это ничего особо не даёт.

Поидее могут. К нам ездят (правда, не по туристической, а по культурному обмену, но это тоже "не рекомендуется"). Более того, несмотря на статус, со стороны России никаких ограничений нет, даже можно получить электронную визу на 14 дней на въезд.

Но японцы очень осторожны и законопослушны и "не рекомендуется" для них часто значит "нельзя"

Тут скорее нужно в индивидуальном случае смотреть. Если японец работает в крупной компании и как-то может всплыть информация о его поездке в Россию, это может как-то повредить репутации, например.