Я родился в Азербайджанской ССР и фамилия у меня азербайджанская. но я гражданин РФ. если полечу в Европу с пересадкой в Ереване у меня могут быть проблемы в Армении или в Азербайджане в дальнейшем? Может кто летал?

думаю ,никаких проблем нет

Добрый вечер!

У меня была похожая ситуация, с той разницей что родился в Москве, и у меня гражданство двойное РФ/Румыния.

В 2023 ездил в Грузию транзитом через Армению, по румынскому паспорту.

На армянской границе сразу вызвала много подозрений фамилия, спрашивали про мою национальность, семью, родственников в Азербайджане (я был не готов к такому) - паспорт унесли на проверку. Вернулись и пустили

В 2025 впервые был в Азербайджане, заехал по РФ паспорту - ноль проблем.

Если есть возможность - не рискуйте, летите другим путем.