Планируем в августе поездку в Дагестан на машине. Подскажите, пожалуйста, в горах лучше остановиться в Чохе (рассматриваю исключительно Этнодом) или в Гунибе?

В Гунибе. И оттуда съездить в Чох. И ещё много куда. А от Чоха особо не поездишь. Если есть дни, можно одну ночёвку в Чохе запланировать, остальные в Гунибе. Можно ещё где-то поближе к Вашим точкам интереса, хоть каждый день на новом месте ночевать - так интересней!