Можно сейчас в магазинах Эстонии расплатиться купюрой 500 или 200 евро? У кого был опыт?

Это не запрещено и, в целом, реально.

500тки не берут нигде, их только в банке возьмут, они выходят их обихода и изымаются. 200 берут, но далеко не везде и неохотно..

Призма была одной из последних, кто брал. Год или полтора назад им скинула 500

Это где интересно не берут 200 евро или 500 в какой стране? Они не изъяты из оборота, да их могут проверить, но это платежные средства

Берут. Законные платежные купюры. Проверяют только долго.