По утд Литвы в Калининград только на машине надо ехать? Про поезд знаю, речь если едешь автобусом с пересадками, так нельзя?

учитывая, что на ЖД УПД-ЖД форма, то скорее всего без вариантов =)

Не обязательно на авто, кто-то даже пешком с УТД переходил границу. Фишка в том, что территорию Литвы нужно покинуть в течении 24 часов с противоположной стороны. При въезде пограничники могут поинтересоваться, как вы это собираетесь сделать (билеты)