Подскажите, а если билет не единый, а раздельный, не пустят в Молдову?

Нет конечно, логично что белый паспорт = свидетельство на возвращение домой, соответственно путь РФ - РМ, т.к. нет прямого сообщения, в третью страну можете въехать тол ко транзитом, не имеете право выходить в город = только через транзитную зону