Подскажите пожалуйста, можно ездить в России на машине с Армянскими номерами ,когда у водитель есть два гражданства?

Да, автомобиль с армянскими номерами можно привезти в Россию, так как Армения является членом Евразийского экономического союза (ЕАЭС Никакие временные ввозы и прочие режимы к Вам отношения не имеют — Вы передвигаетесь внутри таможенной территории ЕАЭС.