Планирую поехать из Турции в Грецию на острова - Родос, Санторини, Миконос. Смотрю в омио - ценник на водный транспорт очень дорогой и ходит не каждый день. Не подскажете, там действительно все так плохо с транспортом?

Почему не каждый день? Вы где смотрите?

С Родоса удобнее, имхо, на Крит самолетом лететь, летают ежедневно, час пути, но тоже билеты не дешевые.

Оттуда на Санторини, с Санторини на Миконос, но это все не дешево, да, и сами острова Миконос и Санторини - самые дорогие острова Греции))

Если хочется дешевле и проще - то Турция - Родос - другие многочисленные греческие острова Додеканеса.