Подскажите пожалуйста. Могу ли я гр-н России с визой С вместе с мамой не гражданкой Латвии ехать в Латвию через Эстонию?

Если не ошибаюсь, то не можете.

Напишите на границу, они отвечают. Супруги если едут вместе могут въезжать через эстонскую границу ( если у одного гр.РФ, другого ЛР). В вашем случае - не знаю. Обратно в Россию через Эстонию граждане РФ свободно могут ехать все.