Можете подсказать как лучше сделать: Парень россиян работает на иностранную компанию, приедет в рф оформлять визу в Японию.

Вы можете спонсорское письмо ( насколько я знаю родства здесь не нужно)

Если не расписаны никакого спонсорского письма оформить нельзя(

Только ближайшие родственники (супруги/родители)

Справка о доходе просто от компании подтверждение, что парень там работает на указанной должности.

Деньги на банке, разве нельзя просто выписку со счёта показать? С российским банком мы просто показывали выписку со счёта, типа "на дату Х там У денег" и всё приняли