Подскажите пожалуйста ,а можно купить транспортную карту в Токио на 3 дня в аэропорту и за наличные деньги?

Да, в автомате suica welcome, если вы про Токио. Она действует 28 дней

Или в офисе JR

Купите welcome suica в аэропорту, положите на неё 1000-1500 йен, и по ней доезжайте из аэропорта до отеля и обратно в аэропорт при вылете.

В самом Токио можете передвигаться по 3х дневному проездному на метро. Он продается на трип ком и стоит около 900 руб за три дня. Он выдаст вам куаркод, а вы его распечатайте на станциях метро в виде проездного в спец автоматах. В инструкции на трип всё будет указано.

Чтобы передвигаться по нему стройте маршрут в гугл картах и в фильтрах отметьте чтобы показывал именно метро, тк может показывать маршруты линии JR на которые проездной не распространяется. Для понимания линии метро обозначаются одной буквой, другие линии в основном 2 буквами.

Если я правильно поняла, вы будете в Токио 3 дня, скорее всего будете передвигаться по популярным местам и метро там ходит. Если куда то уедете, где будут другие линии, то просто оплатите с велком суйки.