Как выглядит рабочая справка для посольства, для оформления визы в Японию?

Унифицированной формы справки с работы нет. Потому нет ничего странного и страшного, что ваши справки различаются.

При этом работодатель не в праве отказать указать те сведения, что он может подтвердить. То есть если вам понадобится справка с датами отпуска, работадатель обязан это внести в справку

Но для японского консульства это не требуется.