У кого из Эстонии виза многократная в Россию, если на 10 и более дней ехать в Питер, надо регистрироваться в миграционном центре?

Регистрация вам нужна в любом случае - закон Российской Федерации

Обязанность быть зарегистрированным по месту пребывания в рф наступает чр 7 рабочих дней с даты прибытия к месту пребывания. Если Вы посещаете несколько пунктов и ни в одном не находитесь более 7 р.дней, то и регистрироваться не надо. Такое обстоятельство желательно документировать ( собирать билеты, брони отелей и др,) чтобы пояснить в случае вопросов сотрудникам МВД.