Подскажите, гражданину Казахстана чтоб сделать регистрацию после получения внж в рф в муниципальной квартире, достаточно ли присутствия владельца квартиры?

Не владельца, а нанимателя) Если вы ему близкий родственник и больше нет совершеннолетних, с ним проживающих, то достаточно) Если же нет, то согласие муниципалитета еще нужно и всех зарегистрированных совершеннолетних.