Если билет Киото-Нара , можно по нему выйти в Удзи и потом продолжить поездку до Нары , или покупать два билета на двп сегмента пути ? )

Не уверен, может зависит от компании перевозчика, конечно, но по идее при выходе у вас же билет в турникете заберут. Лучше уточнить на кассе или покупать отдельно имхо

Конечно, два билета.