Если в течение 72 часов не приходит никакого ответа по e визе в Индию, можно снова подаваться? Или ждать?

А какой статус заявления в текущий момент?

При каждой подаче нужно оплачивать визовый сбор)

Намёк. Еще раз проверьте все на ошибки. И напишите в support. Потому что они не обязаны вам разъяснять что у вас не так. Вы должны писать и справляться как идёт. Если всё окей визу выдают сразу, а так, если есть несоответствие, зачем ему заморачиваться просто переходит к другой заявке. Ваша висит и потом отказ автоматом.