А есть ли риск при одобрении визы в Испанию, если прилёт в один город, вылет из другого, а бронь отеля только в одном городе? Или обязательно надо в этих разных городах бронировать?

Не обязательно, главное все ночи чтобы были с жильем

Все должно быть логично.

Например, если у вас вылет в 7 утра из «другого» города, то может возникнуть вопрос , как вы туда к 7 утра доберетесь. ( а вы в аэропорту, например, ночевать решили)

Но сделать бронь на одну ночь в городе вылета в таком случае, не составит труда, зато поможет избежать лишних вопросов.