Сейчас паромное сообщение у России с Японией?

Есть. Южнокорейский паром ходит. Он хитро ходит, не нарушая запретов. Типа он идет в Владика в южнокорейский порт. А уже от туда в Сакаиминато. Но, не советую. Дорого, долго и японский порт в глухомани. Проще и лучше самолетом. Но если есть желание поблевать в море, то можно через Пусан, там быстроходное судно ходит в Фукуока.