Подскажите пожалуйста, кому то известны случаи когда Эстония через границу в Нарве пускала с визой C в исключительных случаях?

Исключительные случаи, это какие? К близким родственникам пропускают.

Супругов граждан ЕС пускают (в сопровождении или без, от статуса зависит)

С шенгенской визой "С" Вы можете выйти из рф, прийти на эстонский кпп и рассказать полицейским, чем именно Ваш случай исключителен.

И ждать их решения.

Только в случае, если ваш супруг - гражданин ЕС и вы едете вместе; либо вы едете к прямому родственнику в Эстонии (родители-дети-внуки), которые либо граждане Эстонии, либо имеют эстонский ПМЖ