Подскажите, пожалуйста, может у кого-то так было: подали документы в визовый центр Испании, а получили сообщение от авиакомпании об отмене рейса. В этом случае нужно каким-то образом связываться с визовым центом или как быть?

Никак.

Успокойтесь и ждите ответа про вашу визу.

Это, что касается ваших доков на визу. Ничего без запроса от консульства вы донести/изменить уже не можете.

А, что касается отмены рейса, если вы им , реально, хотели воспользоваться, это вы с авиакомпанией разбирайтесь..

Нет, конечно. Полетите, когда сможете. Не захотите - не будете использовать визу вообще.